W grze mamy do czynienia z potężną organizacją, która stanowi śmiertelne niebezpieczeństwo dla całego świata. Pewnego dnia, łowca nagród Raya przypadkiem natrafia na Theo – młodego człowieka, który został zaatakowany przez bandytów. Po zażegnaniu niebezpieczeństwa i uratowaniu Theo, obydwoje wyruszają w podróż, która wrzuci ich w sam środek okrutnego spisku, zmuszając bohaterów do konfrontacji z Kultem Arshedd i Imperium Galvaris. Eclipse of Illusion zaopatrzono w rozmaite zbroje do przywoływania, które można modyfikować według własnego uznania.
